Muzeum zostało urządzone w zachowanych podziemiach dawnych obiektów klasztornych. Najcenniejszym reliktem jest autentyczna piekarnia z zachowanym piecem i narzędziami używanymi do wypieku chleba oraz posadzka, po której chodziła św. Siostra Faustyna. Apostołka Bożego Miłosierdzia przebywała w płockim klasztorze w latach 1930-1932, pracowała w sklepie piekarniczym oraz pomagała w kuchni i przy wypieku chleba. Zamieszczone w Muzeum zdjęcia i eksponaty ukazują historię domu, jego życie i pracę, służą upamiętnieniu pobytu św. Siostry Faustyny w tym klasztorze, ukazaniu jej drogi do świętości oraz historii i rozwoju kultu Miłosierdzia Bożego. Muzeum stwarza możliwość pogłębienia znajomości życia i posłannictwa św. Siostry Faustyny.
Obecnie ze względu na prowadzone prace związane z rozbudową Sanktuarium Muzeum jest nieczynne.
